Nội dung của phim Huyễn Ảnh Đặc Công xoay quanh 3 nhân viên CIA, những nhà nghiên cứu đang làm việc cho dự án VR Fighter là Blue (Trần Tuệ Lâm), Tango (Trịnh Y Kiệt), và C.S. Koo (Trần Tiểu Xuân) họ là những nhân tố quan trọng trong kế hoạch giúp CIA có thể đào tạo bất kỳ người nào từ mốc xuất phát là không có chút kỹ năng nào thành một người có kỹ năng chiến đấu tuyệt vời.

Tuy nhiên, trong quá trình thực hiện thì những sự cố ngoài ý muốn đã xảy ra khiến cho Tango và C.S. quyết định tự đào tạo, bởi vì Alien là một kẻ khủng bố quốc tế đã giết vị hôn thê của C.S. và bắt cóc Blue vì âm mưu của hắn. Tuy nhiên, các tác dụng phụ của VR Project VR đã gây ra một vấn đề nghiêm trọng giữa hai người bạn khiến họ quay lại thành những kẻ thù của nhau.