Nội dung của Ký Sinh Thú 1 xoay quanh nhân vật Izumi Shinichi là một thiếu niên 17 tuổi, sống cùng bố mẹ tại một khu phố yên tĩnh ở Tokyo. Một đêm nọ, những sinh vật ngoài hành tinh, có hình thù giống loài sâu, với tên gọi Kiseijū (“Ký sinh vật”) đổ bộ lên Trái Đất, chiếm lấy não và điều khiển chủ thể là con người bằng cách xâm nhập qua tai hoặc mũi.

Một “Ký sinh vật” có ý định bò vào tai của Shinichi khi cậu ngủ nhưng thất bại vì cậu đang đeo tai nghe, vậy nên đã xâm nhập cơ thể cậu bằng cách chui vào tay và điều khiển cánh tay phải, và sau đó lấy tên là Migi. Migi từ đó đã theo chàng trai đi khắp mọi nơi, từ trường đến nhà cho tới những buổi hẹn, tất nhiên ý định của Migi lúc đầu sẽ là ăn não của chàng trai, tuy nhiên theo thời gian, Ký Sinh Thú này lại nảy sinh tình bạn với Izumi , 2 con người trở thành những người bạn thân thiết giúp đỡ lẫn nhau .

Sóng gió ập đến khi những sinh vật ở mức độ cao hơn Migi, những đồng minh và kẻ thù của Migi xuất hiện, liệu 2 con người có còn bảo vệ được nhau…